Fundacja Pro Kolej powstała w 2013 jako platforma współpracy firm, administracji, pasażerów, nadawców i odbiorców ładunków. Doświadczenie ekspertów związanych z Fundacją oraz samej organizacji opiera się na szeregu przeprowadzonych z sukcesem projektów. Pozwala ono na dzielenie się wiedzą w zakresie szans  i zagrożeń dla branży oraz pozytywnych efektów gospodarczych i społecznych rozwoju transportu kolejowego. Wiarygodność i rozpoznawalność organizacji wzmacnia jej pozycję w debacie na temat kształtu polskiej i europejskiej polityki transportowej.